Filipe Marques é natural de Évora. Iniciou os seus estudos musicais com oito anos de idade, na Academia de Música Eborense, na classe da professora Maria de Lurdes Horta. Prosseguiu os seus estudos nas classes dos professores Dragomir Savov e Tito Gonçalves, concluindo os estudos secundários com este último no Conservatório Regional de Évora – Eboræ Mvsica. Obteve os graus de bacharel e licenciado em Piano e Música de Conjunto no Instituto Politécnico de Castelo Branco, Escola Superior de Artes Aplicadas, na classe do professor Caio Pagano. É mestre em Ensino da Música – Variante de Instrumento e Música de Conjunto pela mesma instituição.